當(dāng)前,單細(xì)胞測序無疑是生命科學(xué)研究的焦點(diǎn),國內(nèi)外越來越多的科學(xué)家爭相涉足單細(xì)胞領(lǐng)域,試圖借助其力量一窺生命的真相。而在這個(gè)過程中,很多科學(xué)家對單細(xì)胞測序技術(shù)是又愛又恨。
愛其能夠解決傳統(tǒng)技術(shù)無法解決的生物學(xué)問題,恨其門檻太高,不知該如何將其恰當(dāng)?shù)匾胱约旱难芯款I(lǐng)域,且價(jià)格昂貴,試錯(cuò)成本難以承受。
愛其能夠幫助獲取非常全面準(zhǔn)確的生物學(xué)信息,恨其提供的數(shù)據(jù)量過于龐大,分析解讀挖掘生物學(xué)意義的過程較為困難,且這個(gè)過程耗時(shí)較長。
近期,丁香園 Biomart BU Head 王輝先生就上述及更多單細(xì)胞痛點(diǎn)問題對話烈冰生物創(chuàng)始人宗杰博士,對烈冰生物的單細(xì)胞技術(shù)發(fā)展、科學(xué)家研發(fā)痛點(diǎn)洞悉和技術(shù)熱點(diǎn)等問題展開討論。
宗杰博士(左)王輝先生(右)
王輝:烈冰生物長期從事高通量測序領(lǐng)域的科研服務(wù),目前我們看到烈冰在單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)醫(yī)療科研服務(wù)方面具有影響力。也推出了屬于自己的 PanoCell 等單細(xì)胞品牌,現(xiàn)在烈冰在行業(yè)中的總體市場地位如何?
宗杰:高通量測序這個(gè)行業(yè)的發(fā)展和技術(shù)革新有非常大的關(guān)系,2010 年左右還是基因芯片的時(shí)代,那時(shí)候,我們幾個(gè)血?dú)夥絼偟男』镒映闪⒘肆冶铮@ 13 年的時(shí)間,一直在這個(gè)行業(yè)里摸爬滾打,從高通量測序數(shù)據(jù)分析業(yè)務(wù)做起,到 NGS 技術(shù)平臺,到生物信息大數(shù)據(jù)分析平臺、再到現(xiàn)在單細(xì)胞多組學(xué)技術(shù)平臺;從追隨國際一流產(chǎn)品線的腳步到現(xiàn)在有實(shí)力自主開發(fā)國產(chǎn)化的單細(xì)胞多組學(xué)測序服務(wù)平臺,可以說是從「呱呱墜地嬰兒」,逐漸成長為足以「挑起大梁的精壯青年」。
這兩年我們逐漸做細(xì)產(chǎn)品類別,優(yōu)化產(chǎn)品結(jié)構(gòu),一路穩(wěn)扎穩(wěn)打,根據(jù)上年度全國服務(wù)商的試劑耗材采購量來看,我們已成長為國內(nèi)單細(xì)胞多組學(xué)測序賽道前三甲的服務(wù)公司,這一切要感謝我們和客戶間的通力合作,感謝每一位烈冰人的付出,成就了烈冰的今天。
王輝:NGS 測序行業(yè)技術(shù)產(chǎn)品眾多,是什么原因讓烈冰選擇并堅(jiān)持專注于單細(xì)胞多組學(xué)賽道呢?
宗杰:首先我們烈冰認(rèn)為單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組是同一件事情,都是可以超高精度的解析組織和細(xì)胞,真正研究組織中異質(zhì)的細(xì)胞類群、細(xì)胞的演化和細(xì)胞類群之間的互作關(guān)系。單細(xì)胞作為近年興起的前沿技術(shù),給全球的科學(xué)家提供了前所未有的生命醫(yī)學(xué)探索新視角,在生命醫(yī)學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域全面開花并且至今熱度不減,這都要依賴于該技術(shù)的強(qiáng)大基礎(chǔ)研究和應(yīng)用實(shí)力,我個(gè)人和我們公司都非??春脝渭?xì)胞測序行業(yè)的發(fā)展,雖然技術(shù)的洪流不會(huì)就此停止,但不論何種新興技術(shù)出現(xiàn),單細(xì)胞技術(shù)依舊是高精度高深度研究的基石,會(huì)持續(xù)地為全球生命醫(yī)學(xué)健康事業(yè)做出貢獻(xiàn)。
另外選擇單細(xì)胞測序賽道也是延續(xù)烈冰 NGS 服務(wù)的傳統(tǒng)優(yōu)勢,單從產(chǎn)出數(shù)據(jù)量來看,單細(xì)胞多組學(xué)比普通測序提高了 20 倍,它能看到的廣度和深度是現(xiàn)有的其他技術(shù)不能比擬的,這種全新的分子視角下能捕捉到更深層的生命密碼,也對實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)分析均提出了更高的要求,而這恰恰是我們近 10 年積累的優(yōu)勢所在,我們非常看好單細(xì)胞多組學(xué)在生命醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的重大作用及其未來臨床落地轉(zhuǎn)化地發(fā)展趨勢,單細(xì)胞多組學(xué)作為下一個(gè)高通量測序「風(fēng)口」,值得我們集全公司之力在這一賽道深耕細(xì)作,力求實(shí)現(xiàn)「單細(xì)胞多組學(xué)醫(yī)療 2.0 時(shí)代領(lǐng)航者」的企業(yè)愿景。
王輝:您認(rèn)為烈冰能夠打開單細(xì)胞多組學(xué)局面贏得市場、贏得客戶信任的最主要的原因是什么?
宗杰:市場和客戶的認(rèn)可是對我們的信任,這份信任更是我們的一份責(zé)任,以信任換信任就是以真心對真心。在我看來,「真心」就是 2 件事:其一,平臺硬,產(chǎn)出數(shù)據(jù)質(zhì)量高,經(jīng)得起研究和市場的考驗(yàn);其二,全流程服務(wù)效率高,提供超預(yù)期的產(chǎn)品和服務(wù),給客戶不得不選我們的理由。
我們搭建了兩大國際平臺和自研國產(chǎn)化平臺的多重產(chǎn)品線,滿足客戶多樣化的產(chǎn)品服務(wù)需求,這種服務(wù)模式和質(zhì)量最直觀的體現(xiàn)是我們服務(wù)的客戶發(fā)表了一系列高質(zhì)量的文章并給予我們作者或致謝,目前我們已累計(jì)協(xié)助客戶發(fā)表單細(xì)胞文章 70 余篇,平均 IF 近 20 分。IF>10 分以上占比 60%,20 分以上占 30%,還有四篇頂刊。僅今年短短的 2 個(gè)月時(shí)間,我們的客戶就發(fā)表了 4 篇文章,均在 10 分以上,其中包含一篇30 分的Science Immunology。
高質(zhì)量的服務(wù)離不開公司實(shí)驗(yàn)和技術(shù)團(tuán)隊(duì)深度參與和服務(wù)鏈條優(yōu)化,我們始終堅(jiān)守烈冰正直、睿智、拼搏、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膬r(jià)值理念,認(rèn)真負(fù)責(zé)的對待客戶的每一個(gè)項(xiàng)目、每一例樣本,堅(jiān)信「正者無敵」,腳踏實(shí)地優(yōu)化服務(wù)中的十多個(gè)環(huán)節(jié),從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)探討、樣本收樣、儲存、前處理、消化解離、質(zhì)檢、捕獲、反轉(zhuǎn)錄、建庫、上機(jī)測序、數(shù)據(jù)分析、結(jié)果解讀與可視化呈現(xiàn)等等。每個(gè)環(huán)節(jié)建立嚴(yán)格規(guī)范的 SOP,專人核對,實(shí)時(shí)上傳系統(tǒng)記錄,每個(gè)環(huán)節(jié)操作與管控做到全流程可回溯。
高質(zhì)量的完成實(shí)驗(yàn)與數(shù)據(jù)分析等服務(wù)內(nèi)容是一個(gè)好的基礎(chǔ),跑贏時(shí)間和定制化分析在我來看也是贏得客戶和市場信任的重要因素。我們反復(fù)優(yōu)化服務(wù)環(huán)節(jié)溝通方式,提供整體方案和高度定制化的分析策略,并提供客戶可交互的可視化結(jié)果展示系統(tǒng),以此大幅度縮短項(xiàng)目運(yùn)行時(shí)間以及打通客戶與生物信息工程師的溝通壁壘,把寶貴的時(shí)間花在幫助客戶深度挖掘生物學(xué)意義上。最終產(chǎn)出質(zhì)量高有價(jià)值的結(jié)果數(shù)據(jù)和研究成果。
總之,我們堅(jiān)持每一個(gè)流程都得到嚴(yán)格遵循,客戶的每個(gè)分析策略和需求都被重視,體現(xiàn)給客戶的是高效的溝通,高度定制化的服務(wù)和生物學(xué)意義挖掘過程中的思想火花碰撞,真正幫助客戶解決科學(xué)問題,以此獲得客戶和市場的廣泛認(rèn)可。
王輝:目前單細(xì)胞服務(wù)商眾多,烈冰生物在諸多競爭中相對競爭對手有什么樣的護(hù)城河?
宗杰:首先是端正態(tài)度,對我們來說,科技服務(wù)從來不是小事情,一個(gè)個(gè)的項(xiàng)目進(jìn)展往小了說是幫助客戶實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)結(jié)果的挖掘,或者發(fā)一篇科研論文;往大了說,我們在用自己的形式推動(dòng)那些未知的、神秘的基礎(chǔ)研究與探索發(fā)現(xiàn)盡可能地實(shí)現(xiàn)。22 年我們的一個(gè)用戶,在 nature 上發(fā)表的 CAR-T 治療腫瘤的重大臨床突破,更是堅(jiān)定了我們的想法與初衷,我們堅(jiān)信未來會(huì)有更多的科研工作者因?yàn)槲覀兊漠a(chǎn)品也好或者服務(wù)也好,在生命醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的齒輪中推著它向前走,讓科學(xué)探索與研究發(fā)現(xiàn)照進(jìn)現(xiàn)實(shí),最終實(shí)現(xiàn)全民醫(yī)療事業(yè)的大健康。
第二是「銳意進(jìn)取,持續(xù)創(chuàng)新」,這也是我們烈冰的執(zhí)著。我們成立初期還是只做數(shù)據(jù)分析服務(wù)的小公司,幫助學(xué)者快速解讀基因信息;后來發(fā)現(xiàn)市場上拿到的原始數(shù)據(jù)質(zhì)量良莠不齊,為解決上游實(shí)驗(yàn)質(zhì)量問題保證數(shù)據(jù)質(zhì)量,我們擴(kuò)寬業(yè)務(wù)開始做實(shí)驗(yàn)+分析一體的服務(wù),高通量測序的發(fā)展我們敏銳的察覺到生信大數(shù)據(jù)的發(fā)展趨勢,在 2015 年即開發(fā)完成了國內(nèi)首個(gè)智能化生物大數(shù)據(jù)分析平臺——NovelBrain®,建立起一套標(biāo)準(zhǔn)化分析和結(jié)果呈現(xiàn)流程,在業(yè)內(nèi)還需要命令行寫代碼跑分析腳本的年代,我們已經(jīng)率先實(shí)現(xiàn)了一站式自動(dòng)化基因大數(shù)據(jù)的高性能計(jì)算,分析,存儲和信息挖掘呈現(xiàn)。
2018 年單細(xì)胞測序技術(shù)異軍突起,我們認(rèn)為該技術(shù)將成為繼 NGS 測序后的下一個(gè)「風(fēng)口」,因此在搭建國際進(jìn)口平臺生產(chǎn)線的同時(shí),我們也啟動(dòng)了【烈冰智造】計(jì)劃,在試劑耗材和設(shè)備開發(fā)的上游生產(chǎn)環(huán)節(jié)不斷發(fā)力,希望通過自主創(chuàng)新技術(shù)開發(fā),打破國外平臺的技術(shù)壟斷壁壘,研發(fā)國產(chǎn)化單細(xì)胞測序服務(wù)平臺,惠及更多的科研和臨床工作者,也應(yīng)對未來單細(xì)胞測序賽道的激烈競爭。該計(jì)劃目前已獲得包括核心發(fā)明專利、軟件著作權(quán)、版權(quán)和商標(biāo)等在內(nèi)的近百項(xiàng)自主知識產(chǎn)權(quán)積累,借助自主技術(shù)創(chuàng)新,目前我們已成功推出 NovelBrain® 生物信息云平臺,PanoCell 單細(xì)胞測序系列產(chǎn)品等,NovelPano-SPtissue 空間轉(zhuǎn)錄組測序產(chǎn)品也取得重大進(jìn)展,不期將會(huì)和大家見面。同時(shí),我們也在單細(xì)胞可視化和沉浸式體驗(yàn)方面也開展了大量的工作,希望能為客戶提供更優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品,更快更深入地分析數(shù)據(jù)和解讀生物學(xué)意義。
我們希望將烈冰打造為生產(chǎn)商中最懂客戶的實(shí)力型技術(shù)服務(wù)公司,服務(wù)商中首屈一指的技術(shù)平臺開發(fā)設(shè)計(jì)生產(chǎn)公司,建設(shè)集成研發(fā)、生產(chǎn)、服務(wù)和臨床轉(zhuǎn)化的多元視角下全流程閉環(huán)產(chǎn)業(yè)鏈,做到想客戶之所想,實(shí)現(xiàn)人無我有,人有我精,才能成客戶之所成,也是成烈冰之所成。
王輝:生物信息云平臺 NovelBrain 是烈冰生物開發(fā)的拳頭產(chǎn)品,受到很多使用者的好評。相對于國外同類平臺,NovelBrain 的優(yōu)勢主要有哪些?NovelBrain 如何能助力科研工作者從單細(xì)胞數(shù)據(jù)中挖掘生物學(xué)意義?
宗杰:NovelBrain® 生物信息云平臺一直是我引以為豪的產(chǎn)品,它是依托分布式和大數(shù)據(jù)技術(shù)建立的一套全方位集成化的基因大數(shù)據(jù)分析和可視化展示系統(tǒng),可一站式提供 NGS數(shù)據(jù)的高性能計(jì)算,分析,存儲,數(shù)據(jù)挖掘和可視化在內(nèi)的全套解決方案。
該平臺整合了 600 多個(gè)生物信息相關(guān)分析工具,50 多個(gè)分析 pipeline,針對基因組、轉(zhuǎn)錄組、甲基化、Chip-seq、全基因組、外顯子等測序技術(shù)的數(shù)據(jù)分析均配備了完備的分析工具和分析流。用戶可以通過簡單的框線拖拽操作,輕松運(yùn)行分析流程,實(shí)現(xiàn)高度定制化分析并一鍵導(dǎo)出結(jié)果報(bào)告,為用戶提供高效精準(zhǔn)的可交互分析策略。
在烈冰進(jìn)入單細(xì)胞領(lǐng)域后,平臺針對單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的特點(diǎn)進(jìn)行了深度開發(fā),上線了 300 多個(gè)單細(xì)胞相關(guān)的分析工具,覆蓋了目前 95% 以上的單細(xì)胞算法,并且我們的生物信息團(tuán)隊(duì)還緊追國際前沿,持續(xù)地添加更多的單細(xì)胞分析工具和更好的分析流程。
在此基礎(chǔ)上,我們還根據(jù)目前大量成功的單細(xì)胞項(xiàng)目,結(jié)合國際最新的單細(xì)胞進(jìn)展,整理為一套成體系的單細(xì)胞生物學(xué)意義挖掘思路,并將該思路提煉為單細(xì)胞可視化系統(tǒng)。該系統(tǒng)支持實(shí)時(shí)的可視化分析結(jié)果呈現(xiàn)和聯(lián)動(dòng)交互功能,解決傳統(tǒng)分析「大海撈針式」結(jié)果查閱痛點(diǎn):報(bào)告篇幅甚巨,閱讀成本過高;結(jié)果堆砌主次難辨,且不便關(guān)聯(lián)解讀等問題,快速篩選單細(xì)胞分析結(jié)果關(guān)鍵信息,為用戶省去了諸多繁瑣的生信分析流程,將注意力集中于生物學(xué)意義本身,幫助科學(xué)家和臨床學(xué)者快速獲取項(xiàng)目研究關(guān)鍵信息,深度挖掘單細(xì)胞數(shù)據(jù)背后的價(jià)值。目前這應(yīng)該是行業(yè)內(nèi)最好的單細(xì)胞生物學(xué)意義挖掘系統(tǒng)。
王輝:隨著新冠疫情管控的放開,各行各業(yè)包括科研工作預(yù)計(jì)將逐步恢復(fù)正常。在未來 3-5 年,烈冰生物的主營業(yè)務(wù)領(lǐng)域的發(fā)展目標(biāo)是什么?具體有哪些布局?
宗杰:烈冰伴隨高通量測序領(lǐng)域一起蓬勃發(fā)展了 10 余年,期間我們一直是「重服務(wù)型企業(yè)」,在服務(wù)和優(yōu)化服務(wù)的過程中逐漸聚焦到單細(xì)胞多組學(xué)測序賽道中來,但我們不滿足于僅僅是服務(wù)型公司,只做新興技術(shù)發(fā)展的跟隨者,我們更希望能成為單細(xì)胞多組學(xué)賽道的「弄潮兒」。我們將腳踏實(shí)地,聚焦當(dāng)下,在單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域持續(xù)發(fā)揮自主創(chuàng)新優(yōu)勢,逐步擴(kuò)寬產(chǎn)品類型,以單細(xì)胞多組學(xué)科技服務(wù)為紐帶,建成完整齊備的多組學(xué)檢測服務(wù)平臺和大數(shù)據(jù)可視化分析交付平臺,提供單細(xì)胞測序技術(shù)、空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)等在內(nèi)的多組學(xué)聯(lián)合技術(shù)及分析轉(zhuǎn)化應(yīng)用平臺,著眼全球科技發(fā)展的腳步,強(qiáng)化自身綜合優(yōu)勢,引領(lǐng)技術(shù)迭代和產(chǎn)品更新,積極搶占先機(jī)進(jìn)行市場布局。
未來 3-5 年內(nèi),我們希望通過全體烈冰人的精誠合作,將烈冰打造為「單細(xì)胞多組學(xué)醫(yī)療 2.0 的領(lǐng)航者」,以「全面完備的單細(xì)胞/空間轉(zhuǎn)錄組多組學(xué)解決方案及工具提供、引領(lǐng)生命健康時(shí)代」為使命,踐行烈冰「正直、睿智、拼搏、嚴(yán)謹(jǐn)」的價(jià)值觀,持續(xù)優(yōu)化上游設(shè)備耗材研發(fā)生產(chǎn)、中游科技服務(wù)和下游臨床大數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化的全流程縱深建設(shè),成為單細(xì)胞多組學(xué)綜合性解決方案及工具的提供商。
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